綜合防治香菇病蟲害及雜菌
(1)嚴格把好菌種關 在確定生產用的優良品種以後，菌種是否被雜菌污染則是優質菌種最基本的條件。優質菌種可採用目測和培養的方法來確定。凡菌絲粗壯，打開瓶塞具特有香味，可視為優質菌種。有條件的，還應抽樣培養，同時還可檢查菌絲生活力。
(2)嚴格把好菌袋加工關塑膠袋應選擇厚薄均勻、無沙眼、彈性強、耐高溫、高壓的聚丙烯塑膠袋，培養料切忌太濕，料水比掌握在1∶1.1～1.2；裝料鬆緊適中，上下表內一致；兩端袋口應紮緊，並用火焰熔結，在高溫季節制菌袋時，可用1∶800倍多菌靈溶液拌料，防治雜菌。
(3)嚴格把好滅菌關常壓滅菌應使灶內溫度穩定在100℃，並持續8小時；鍋內菌袋排放時，中間要留有空隙，使蒸氣暢流菌袋受熱均勻；要避免因補水或燒火等原因造成中途降溫；從拌料到滅菌必須在8小時內完成，從滅菌開始到灶溫上升到100℃不可超過5小時，以免料發酵變質。
(4)搞好環境衛生，淨化空氣使空氣中雜菌孢子的密度降得最低，是減少雜菌污染最積極有效的一種方法。裝瓶消毒冷卻，接種、培養室等場所，均需做好日常的清潔衛生。暴雨後要進行集中打掃。堅持每天在空中、地面用0.2%肥皂水或3%～4%石碳酸水溶液，5%甲醛，1∶500倍50%的多菌靈水溶液及5%～20%石灰清水等交叉噴霧或噴灑，將廢棄物和污染物及時燒毀或浸入藥水缸，以防污染環境和空氣。
(5)嚴格無菌操作
接種室應嚴格消毒；做好接種前菌種預處理；接種過程中菌種瓶用酒精燈火焰封口；接種工具要堅持火焰消毒；菌種儘量保持整塊；接種時要避免人員走動和交談；及時清理接種室的廢物，保持室內清潔。
(6)科學安排接種季節 必須根據香菇菌絲生長和子實體發生對溫度的要求，科學安排接種季節。過早接種或遇夏秋高溫氣候，既明顯增加污染率，又不利菌絲生長；過遲接種，污染率雖然較低，但秋菇生長期縮短，影響產量。接種以日平均氣溫穩定在25℃左右時為最好。
夏季氣溫偏高時，接種時間應安排在午夜至次日清晨。
(7)改善環境因數雜菌發生快慢和輕重，在很大程度上取決於各種環境因數，特別是香菇栽培塊或菌筒上的黴菌發生時應通風換氣。溫度、濕度等環境因數有利於香菇生長發育時，香菇菌絲生活力旺盛，抗性強，雜菌就不易發生，反之，雜菌便會乘虛而入，迅速發生。因此，在日常管理工作中，盡可能創造適宜於香菇菌生長發育的環境條件也是一項很重要的預防措施。
(8)減少菌絲未癒合時發生黴菌，採取將門窗關好(定量開窗通風幾次)，除去覆蓋的薄膜，待控制黴菌後再蓋上的措施。若個別栽培塊發生黴菌，不要急於處理，待菌絲癒合後再作處理，但需增加掀動薄膜的次數，並加強栽培室通風換氣和降溫減濕。
(9)黴菌發生在栽培塊或菌筒表面，尚未入料，一般可以採用pH 8～10的石灰清水洗淨其上的黴菌，改變酸鹼度，抑制黴菌生長。若黴菌嚴重，已伸入料內，可把黴菌挖乾淨，然後補上栽培種。黴菌特別嚴重的栽培塊或菌筒，可拿到室外，用清水把黴菌沖洗乾淨，晾乾2～3天后，再噴灑0.5%過氧乙酸(CH3COOH)可收到顯著的防治效果。
(10)加強檢查在氣溫較高季節，培養室內菌袋排放不宜過高過密，以免因高溫菌絲停止生長或燙傷，影響成品率。發菌5～6天后，結合翻堆要逐袋認真檢查，發現污染菌袋隨即取出。對污染輕的菌袋，可用20%甲醛或5%石碳酸或95%酒精注射於污染部位，再貼上消毒膠布。
對青黴、木黴污染嚴重的菌袋，添加適量新料後重新滅菌接種；污染鏈孢黴的菌袋，及時深埋。此外，要防鼠滅鼠，避免老鼠間接污染，對污染廢棄的菌袋要集中處理，千萬不能到處亂扔，以免造成重複感染。
(11)袋料栽培中危害香菇的害蟲主要為蟎類和線蟲。菌筒室內培養期間主要是蟎的危害，後期主要為線蟲。培養室或栽培場發生害蟲危害可噴高效低毒農藥，1∶1 200～1 500倍的特殺蟎，1∶50倍的殺蟲乳劑和1∶500倍的馬拉松乳劑防治線蟲可收到良好效果。
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